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体細胞変異の低頻度バリアントを信頼性高く検出する検出系を構築中です。
私たちは固形臓器に蓄積する遺伝子変異のゲノム解析を進めており、体細胞変異の低頻度バリアントを信頼性高く検出する検出系を構築中です。今回、Twist cfDNA Library調製キットを用いることで、微量(1.5ng)の断片化DNAから、PCRサイクル数を1サイクル減らしても従来法に匹敵するライブラリ収量が得られるだけでなく、既存のターゲットキャプチャシーケンスの平均カバレッジを分子バーコード処理後に30%程度高めることが可能であることが分かりました。Twistのライゲーション処理は簡便で短時間にライブラリ調製が可能であり、分子バーコードを用いた微量系のアプリケーションの広がりが期待されます。
京都大学 医学研究科 腫瘍生物学講座 特定准教授 垣内伸之
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ウェビナー cfDNA
複数のがんの検出を可能にする DNAメチル化に基づくリキッドバイオプシー 中国企業AnchorDx Medical Co. Ltd.で実施された、Twist Methylation Panelを用いた cfDNA メチル化分析による複数の消化器系がんの検出についてご紹介します。
早期がん検出の感度を向上させるcfDNAのターゲットエピゲノム配列決定 Targeted Epigenome Sequencing of cfDNA to Improve Sensitivity for Early Cancer Detection:ケンブリッジ大学で評価されたcfDNA分析(NEB-to-Twistのワークフローの優位性、パネルの堅牢性、パフォーマンスなど)について示して頂いております
Enabling disease specific research using dynamic targeted sequencing:Broad研究所が開発したcfDNAのターゲットエンリッチメントのワークフローについてご紹介します。